No usaría TrueCrypt porque ya no se mantiene activamente, por lo tanto, ya no es seguro de usar. Los estados del sitio web de Truecrypts "ADVERTENCIA: el uso de TrueCrypt no es seguro, ya que puede contener problemas de seguridad no solucionados"
Recomendaría el uso de la función incorporada de Apple, ya que es seguro y, por supuesto, sus archivos están tan protegidos como la contraseña que utiliza para protegerlos. En cuanto a los algoritmos utilizados para cifrar su contraseña, le ofrece dos opciones, elegir la opción más segura es algo más lento de cifrado / descifrado, por supuesto, solo notará la diferencia con archivos grandes. Puede elegir algoritmos AES de 128 o 256 bits. El cifrado AES de 128 bits y / o 256 bits son muy seguros. TSL / SSL lo utilizan para cifrar el tráfico de extremo a extremo a través de Internet, se considera entre los principales cifrados (Aunque la NSA tiene categorizó esto para estar en Grado B, y su recomendación es usar claves de 256 bits para el cifrado) . De todos modos, para responder a su pregunta, la mayoría de los programas de terceros ofrecen AES entre otras opciones para cifrar sus datos, por lo tanto, no veo ninguna razón por la que no deba usar la función incorporada para el cifrado.