La mejor manera de abrir tales archivos es ejecutándolos dentro de un arenero. Sugeriría una máquina virtual.
Con respecto a qué tipo de archivos son seguros, se pueden hacer dos distinciones. En la práctica, los archivos como zip, txt, jpg, png, etc. son seguros. Los archivos como .exe, .msi, .com, .bat, .vbs, etc, etc. no son seguros. Sin embargo , hay un gran número con archivos "seguros", es posible que debido a una vulnerabilidad de seguridad en la aplicación que se utiliza para abrirla, la seguridad de su sistema se vea comprometida. Un ejemplo es un 0day publicado recientemente para Acrobat Reader en combinación con archivos PDF creados con fines malintencionados.