GPG Tools es una distribución de GnuPG con algunos complementos front-end y de integración. Todas las operaciones de gestión de claves y criptográficas son manejadas por GnuPG. También puede verificar esto ejecutando gpg --list-keys en la línea de comandos, que mostrará las mismas teclas que las herramientas de frontend conocen.
Además, GnuPG implementa la especificación OpenPGP, así que prefiero llamar a esas claves "claves OpenPGP": también son interoperables con otras implementaciones de OpenPGP (PGP, OpenKeychain, la biblioteca de desarrollo de Monkeysphere, ...).