Creo que estás malinterpretando algunos detalles importantes. Lo más importante es que cualquier intento de rastrear el mensaje de Facebook no rastreará al usuario: solo Facebook. Facebook no es una red de chat peer-to-peer. Ambos se comunican con un servidor central de Facebook, lo que significa que no tiene forma de rastrear al usuario final.
Como resultado, no tienen que usar una VPN para ocultarse. Facebook ya los está escondiendo. Es posible que Facebook pueda rastrear al usuario (de hecho, estoy seguro de que la policía lo solicita comúnmente), pero en el caso de que se esté usando una VPN, es probable que Facebook simplemente rastree al usuario hasta dicha VPN.
Entonces, sin profundizar en el ámbito de lo probablemente ilegal, no hay nada que pueda hacer para rastrear a alguien que se comunica con usted a través de Facebook Messenger, y Facebook ciertamente no lo hará por usted (ni puede hacerlo necesariamente si el la persona está detrás de una VPN).
En este sitio hay otras preguntas que preguntan sobre el seguimiento de las personas detrás de las VPN, que serían aplicables en este caso. Puede comenzar aquí, teniendo en cuenta que esto es aventurarse en el usuario probablemente ilegal y no para su promedio:
¿Se puede seguir realizando un seguimiento cuando se utiliza una VPN? ?