Debes describir los problemas en detalle. Por ejemplo, qué algoritmo se utilizó para cifrar el archivo.
Si cifró el archivo con un archivo de clave utilizando un algoritmo de cifrado fuerte, no podrá descifrar el archivo sin este archivo de clave. La contraseña para el archivo de clave no lo ayudará si no tiene el archivo. Este es un tipo de autenticación de dos factores.
No puedes regenerar los archivos clave. Se generan con números aleatorios. Es bueno que no puedas regenerarlos. Si pudieras hacer esto, un atacante podría hacerlo.
La única forma en que puede recuperar sus archivos es intentar restaurar los archivos clave. Si tienes suerte, puedes restaurarlos desde tu disco duro.
Tu lección aprendida debería ser hacer una copia de seguridad de tus llaves.