No hay ningún beneficio de seguridad para ninguno de los enfoques.
El único beneficio de seguridad que obtendría es al ejecutar los sitios en diferentes servidores, para separar sus funciones. De esa manera, si uno se compromete, los otros quedan intactos. En tal configuración, el número de direcciones IP sigue siendo irrelevante; podría tener direcciones IP de Internet separadas para cada servidor o podría tener algún tipo de proxy inverso al frente con una dirección IP de Internet. Ninguno tiene ningún beneficio de seguridad en particular sobre el otro (aunque este último abre más opciones de alta disponibilidad).