"La identidad del firmante es desconocida porque no se ha incluido en su [...]"
Aparentemente, su cliente de PDF no está contento con su certificado porque debería haberse incluido en su algo . Le sugiero que amplíe la ventana para leer la palabra que sigue a "su", porque esa palabra probablemente será una buena pista sobre cuál es su problema realmente.
Si su software de lectura de PDF es Adobe Reader, puede leer esta página , y para consultar los miembros de la lista de confianza aprobada por Adobe : estas son las CA que Adobe reconoce como Válido para la expedición de certificados para la firma de documentos. No veo ninguna mención de "Comodo" en esa lista, lo que puede contribuir en gran medida a explicar su problema.