No, parece que no entiendes cómo funcionan el cifrado y la ofuscación. El cifrado proporciona confidencialidad: un mensaje está oculto con un mecanismo que utiliza un secreto compartido de todas las partes que no poseen ese secreto.
La ofuscación se refiere a una serie de técnicas empleadas para hacer que, en general, una aplicación de lenguaje de programación de scripting sea difícil de entender para un lector humano. Toman como entrada la aplicación en su forma original (legible por humanos), (una clave) y generan una aplicación funcionalmente equivalente, mayor en tamaño de código y mucho más difícil de entender.
Ahora, para responder a su pregunta, no, no funcionará como usted menciona, puede que no haya autenticación ni cifrado, lo que significa que cualquier atacante pasivo (usando un rastreador de paquetes y ubicado en la misma red que uno de sus visitantes potenciales ) simplemente recupera la contraseña / código javascript en texto plano.