Si entiendo su pregunta correctamente, me pregunta si, cuando se usa un certificado (y una clave privada) para firmar o cifrar datos, ¿ese certificado contiene los algoritmos permitidos para esa firma o cifrado? La respuesta no es realmente.
Fuera del tipo específico de criptografía de clave pública implementado en los certificados (generalmente RSA), puede integrarlos con casi cualquier tipo de algoritmo de cifrado o firma digital. Si desea utilizar AES para cifrar datos, puede hacerlo y utilizar la clave pública de certificado para cifrar la clave de AES. Si desea firmar digitalmente un documento, puede usar SHA-256 para copiar el documento y usar su clave privada cert para encriptar el hash SHA-256.
Estos algoritmos pueden ser casi cualquier cosa que usted elija siempre y cuando cualquier software destinado a procesar los documentos encriptados o firmados sea compatible.
Si, en cambio, está hablando del algoritmo utilizado para firmar el certificado por la CA emisora, entonces sí, eso se encuentra en el certificado.