Si los algoritmos y métodos subyacentes (es decir, la firma) son los mismos, entonces la confianza en el cifrado real no es diferente y en el mundo real hay poca diferencia en el riesgo.
Desde un punto de vista de criptoanálisis teórico, se podría argumentar que si el texto simple que cubre el correo electrónico proporcionara el contexto, ayudaría a un ataque en el texto cifrado, pero algo moderno hace que esto sea en gran medida irrelevante.
También se podría argumentar que si todo el correo electrónico está cifrado, un atacante no sabría qué aspecto del texto cifrado es el correo electrónico y cuál es el adjunto, pero nuevamente si el cifrado es confiable, esto es realmente solo una diferencia teórica en la seguridad. Y siempre que el adjunto esté firmado, un atacante no podrá reemplazarlo (sin que el destinatario lo sepa).
Desde una perspectiva práctica, siempre he confiado en adjuntos cifrados específicamente en lugar de confiar en un mecanismo de cliente de correo electrónico incorporado, esto es para que sepa, antes de usar un adjunto, que ha sido cifrado y, por lo tanto, no importa cuál sea el problema. Al crear y enviar el correo electrónico, el archivo adjunto siempre estará cifrado y solo será accesible para los destinatarios (lo que, en mi opinión, supera cualquier beneficio teórico de cifrar todo el correo electrónico).