No solo debemos pensar en los datos, sino también el sistema de archivos y los metadatos asociados con los archivos, así como el sistema de archivos.
Si ( un gran IF ) podemos determinar con seguridad que BitLocker solo ha cifrado el espacio libre hasta ahora (omitiendo todo lo demás), entonces la pregunta que haga se convierte en al menos una posibilidad teórica (aún depende de cómo se escribe el código de BitLocker (si detecta cambios en el disco después de iniciar el cifrado y cómo maneja dichos cambios).
En general, los datos del sistema de archivos no solo se almacenan al principio, sino que también se almacenan algunas copias redundantes en otros lugares.
Debemos suponer que BitLocker ya ha cifrado dichos metadatos, y cualquier cambio que realice en el sistema de archivos (como la eliminación de archivos) modifica los datos ya cifrados (incluidos los bloques libres, la cantidad de archivos, directorios, etc.).
Así que mi respuesta es NO. Es mucho mejor detener el cifrado por completo; haciendo lo que sea que desee hacer y luego reiniciando nuevamente.