"Configurar el tamaño a 12 MB" no dice mucho.
Algunos sistemas de archivos no se escalan bien hacia abajo. FAT32 reservará espacio para las estructuras de directorios y las tablas de asignación de archivos, lo que le dará un overhead de espacio inutilizable. El espacio real que queda para almacenar archivos será el tamaño del volumen menos que la sobrecarga.
Después de crear el volumen, ábralo (estará vacío) y verifique cuál es el tamaño disponible en realidad.
Aun así, las diferencias en el tamaño del bloque de asignación pueden significar que no puede almacenar lo que en el disco A son 8 megabytes en el disco B, incluso si tiene 8 megabytes libres allí (el "Tamaño de archivo (en el disco)" es lo que importa aquí) . Después de cada copia de archivo, verifique cuánto se ha reducido el espacio disponible.