Dado que usas Filezilla, supongo que estás usando FTP. El siguiente comando se conecta al servidor FTP, se actualiza a TLS y le muestra, entre otras cosas, la cadena de certificados:
openssl s_client -starttls ftp -connect rxdatadirector.catamaranrx.com:21
CONNECTED(00000003)
...
Certificate chain
0 s:/C=US/postalCode=55343/ST=Minnesota/L=Minnetonka/street=9900 Bren Road East/O=UnitedHealth Group Inc./OU=Enterprise SSL Pro/CN=rxdatadirector.catamaranrx.com
i:/C=GB/ST=Greater Manchester/L=Salford/O=COMODO CA Limited/CN=COMODO RSA Organization Validation Secure Server CA
1 s:/C=US/postalCode=55343/ST=Minnesota/L=Minnetonka/street=9900 Bren Road East/O=UnitedHealth Group Inc./OU=Enterprise SSL Pro/CN=rxdatadirector.catamaranrx.com
i:/C=GB/ST=Greater Manchester/L=Salford/O=COMODO CA Limited/CN=COMODO RSA Organization Validation Secure Server CA
2 s:/C=GB/ST=Greater Manchester/L=Salford/O=COMODO CA Limited/CN=COMODO RSA Organization Validation Secure Server CA
i:/C=GB/ST=Greater Manchester/L=Salford/O=COMODO CA Limited/CN=COMODO RSA Certification Authority
3 s:/C=GB/ST=Greater Manchester/L=Salford/O=COMODO CA Limited/CN=COMODO RSA Certification Authority
i:/C=SE/O=AddTrust AB/OU=AddTrust External TTP Network/CN=AddTrust External CA Root
4 s:/C=SE/O=AddTrust AB/OU=AddTrust External TTP Network/CN=AddTrust External CA Root
i:/C=SE/O=AddTrust AB/OU=AddTrust External TTP Network/CN=AddTrust External CA Root
Esto significa que este servidor primero envía el certificado del servidor [0], lo cual es correcto. Luego vuelve a enviar el certificado del servidor [1], lo cual es incorrecto. Luego envía el certificado intermedio [2] que emitió el certificado del servidor, que es correcto. Luego envía el siguiente certificado en cadena [3] que también es correcto. Pero luego envía la CA raíz [4] que no debería enviarse, pero generalmente se ignorará si se envía.
Por lo tanto, debes eliminar [1] y [4] y luego debería estar bien.